喝水时喉咙咕咚声很大一般属于正常的生理现象，不必过于紧张，也不需要进行特殊处理。但是如果咕咚声特别大，并且存在吞咽困难等不适症状，则可能存在食管狭窄的情况，需要及时就医处理。

1、生理现象：在喝水的过程中，吞咽时喉咙的肌肉收缩，会使会厌遮挡住气管，导致口腔内压力变化，进而产生咕咚咕咚的声音。尤其是喝水量大并且吞咽速度快时，咕咚声会变大。建议减缓喝水的速度，并减少一次性喝水的量，情况可能会有所改善；

2、食管狭窄：如果咕咚声特别大可能是由于食管狭窄导致，食管炎、甲状腺肿大等情况都有可能导致食管狭窄，建议到正规医院做检查明确原因。如果是单纯食管狭窄，建议做食管扩张术进行纠正，如果存在食管炎，建议遵医嘱使用奥美拉唑、铝碳酸镁等药物治疗，如果存在甲状腺肿大，可能需要遵医嘱使用甲巯咪唑等药物治疗。